Bohnenberger war Pfarrersohn, und er selbst war für diesen Beruf von elterlicher Seite her vorgesehen. Doch sein Interesse für naturwissenschaftliche Phänomene zog ihn zur Physik und vor allem zur Astronomie. Er entwickelte sich zu einem Universalgelehrten, so schuf er auch auf dem Gebiet der Kartographie, der Erdvermessung und der Instrumentenkunde Wegweisendes. Die württembergische Landesvermessung von 1818 ruhte auf seinen Schultern.

Darüber hinaus verehrten ihn die Tübinger Weingärtner (Gôgen) sehr, da er mit seinen Wettervorhersagen, die eine oder andere Weinernte rettete.